全转录组高通量测序&芯片数据生信分析实战训练营，专家网络授课，互动指导！

要点预览

【医药加】全转录组高通量测序&芯片数据生信分析实战训练营

（训练时间：8个晚上的19：00-22：00，分别是6.8，6.10，6.15，6.17，6.22，6.24，6.29，7.1号）

为帮助广大初学者和具有一定基础的研究者能更好掌握全转录组高通量数据分析的套路与常用技能， 考虑目前在疫情期间的实际情况，我们决定召开【全转录组高通量测序&芯片数据生信分析实战训练营】，为了保证学习效果，我们采用国际顶级的zoom网络会议平台授课，效果体验好！

课程可免费回放，专家微信群指导，确保你能学会！

培训简介

2019年度国家自然基金医学科学部共批资助10138项目，批助金额总计441310万元。初步统计，这些项目中大部分都与编码基因有直接或间接的关联。其中，与通路（pathway）关联的有1349项，金额4.89亿；与miRNA相关的有630项，金额2.3亿；与lncRNA相关的有395项，金额1.45亿；

如何获得有创新意义的疾病靶标基因（mRNA，lncRNA，circRNA，miRNA等）是项目申请及文章写作时最常见的问题。因此我们基于全转录组数据分析的思路，把RNA层面的mRNA、LncRNA、circRNA和miRNA等分子分别给大家做一个分析实操，以及整合这几个RNA的分析思路（具体参见课程表）。

项目类型	题目 金额/万	金额/万 金额/万元
重点项目	FXYD3介导的信号网络对肠道黏膜免疫稳态的调控研究	300
重点项目	基于蛋白-蛋白相互作用精准调节转录因子Nrf2活性及探索其作为肝细胞癌治疗的新靶标	298
重点项目	miR-23b/24-1簇防治烧伤后脓毒症所致MODS的系统研究	297
面上项目	LZTR1基因突变导致的RAS/MAPK通路过度激活以及Noonan综合征相关肥厚型心肌病的机制研究	60
面上项目	SUGP2基因及其突变在遗传性血色病中的致病作用及其机制研究	60
面上项目	WDR73基因突变在Galloway-Mowat综合征中的致病机制研究	60
面上项目	STAG2通过ERK/AKT/GSK3β/c-Myc反馈通路调节甲状腺癌谷氨酰胺代谢的机制研究	60
面上项目	LncRNA FOXF1靶向调控动力相关蛋白1表达在缺氧诱发肺动脉内皮细胞焦亡中的作用及分子机制	55

培训预期：

为了适应生物医药科研工作者的学习效率，我们开展了此次训练营培训班。周期是4周，每周两个晚上，这样完全不影响正常工作。共通过8个晚上（3h/晚，19点~22点）的学习，我们了解全转录组RNA分子的生信分析思路对项目及文章的帮助，以及实操常见的数据库、在线工具和本地软件。使得学员可以自己完成一个完整的分析报告并获得疾病相关的靶标基因。

讲师简介

宋伟博士， 中国精准医疗学会委员

研究成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。

培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向：《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等

课程安排

会议安排：

时间安排	课程表	介绍
第一周	周一 19:00~22:00	生信简介	生物信息介绍
高通量：测序及芯片介绍 非编码RNA的机制、调控模式（miRNA、lncRNA与circRNA）
经典生信SCI文章的解读，了解TCGA数据库、GEO 数据库这些公共数据的挖掘获得创新结论并发文章的思路。 非编码RNA的创新文献解读（含miRNA、lncRNA和circRNA）
TCGA数据库 NCBI GEO数据库	TCGA数据库：最全的癌症高通量数据公共库(简介)
TCGA数据库的介绍和使用（包含了转录组、基因组、表观组和临床信息数据）
GEO数据库介绍：  数据量最大的高通量公共数据库。
GEO数据库的高通量芯片数据查找、筛选、探针转换、差异分析等。
周三 19:00~22:00	TCGA相关的下载工具	TCGA数据库癌症数据下载：RNA-seq数据、miRNA-seq数据、及临床信息数据的下载  TCGA数据书库癌症数据的处理，获得关键mRNA、miRNA的表达谱矩阵。
非编码RNA数据库简介	miRNA  注释数据库（注释及序列下载） lncRNA注释数据库（注释及名称转换） circRNA注释数据库
第二周	周一 19:00~22:00	R语言基础	R软件与Rstudio软件下载、安装、界面。 R语言基础：元素、向量、矩阵、数组 R语言函数：计算函数、统计函数等 R语言路径确认及修改 R语言文件（图、表）的导入和导出
R语言实战	R语言包：包的下载安装 R语言：差异分析limma包使用制作
周三 19:00~22:00	R语言实战	聚类热图制作 R语言pheatmap包做聚类热图
R语言ggplot2构建功能气泡图
基因功能分析	DAVID功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析
通路map图构建
第三周	周一 19:00~22:00	生物网络分析	蛋白与蛋白互作分析（PPI）——STRING数据库
cytoscape软件（上）：网络图构建与美化
周三 19:00~22:00	生物网络分析	cytoscape软件（下）：插件使用
miRNA分析	（1）        差异miRNA分析 （2）        miRNA-mRNA数据库（验证和预测结果） （3）        miRNA与靶基因结合位点（MRE）分析 （4）        VENN图分析 （5）        癌症的miRNA预后分析
第四周	周一 19:00~22:00	lncRNA分析	（1）        miRNA-lncRNA数据库 （2）        lncRNA-target分析 （3）        lncRNA参与的ceRNA分析 （4）        共表达分析
circRNA分析	circRNA-seq高通量测序解读 （1）        miRNA-circRNA数据库 （2）        circRNA参与ceRNA的分析
周三 19:00~22:00	全转录组整合思路	ceRNA（竞争性内源RNA）的机制 ceRNA关系对分析 ceRNA网络构建
结尾	串讲

分析示例图

示例图 通路富集分析结果图

示例图 聚类热图分析

示例图 网络图

                         示例图 pathway map图

示例图 关键基因的KM生存曲线图

示例图 柱状图与venn图

示例图 相关性散点图

学习费用

8晚学费 4200元/每位（集中zoom网络授课，互动性好，可开发票，可回放）

优惠政策

1. 医药加学习班新学员可以分享朋友圈优惠100

2. 医药加学习班老学员可以分享朋友圈优惠200

3. 办理SCI或国自然VIP年卡的学员是免费参加的。

注意：此次课程为线上直播教学模式，Zoom网络会议平台授课，可回放，体验与质量有保证！

报名付费成功后，提前发培训需要应用到的软件与课件，并且指导安装。

参加培训的学员课后可通过微信群继续和授课老师交流，长期获得指导机会。

可以开正规会务发票或者技术服务费发票。

网络学习班报名或者办卡请扫码咨询

医药加网络精讲学习班，专家授课，可回放，互动强！

为帮助广大初学者和具有一定基础的研究者能更好掌握生信分析与临床研究的套路与常用技能， 考虑目前在疫情期间的实际情况，我们决定在5-6月份召开下面五门在线学习班，为了保证学习效果，我们采用国际顶级的Zoom网络会议平台授课，可回放，效果体验好！

【详细介绍点击对应课程标题】

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